Грамотные seo-оптимизаторы уже смогли заметить, что по умолчанию Magento генерирует в sitemap.xml ссылки на товары относительно корня,а не относительно категорий. Почему так делается - и так понятно. Но в Google ваш магазин может попасть под пессимизацию :(

Для выхода из ситуации необходимо сделать custom canonical и поправить sitemap.

Ищем модели:

Генерация элементов разделена (cms страницы,категории,товары), и поэтому можно спокойно добавлять в url товара сгенерируемый адрес категории.

Если у вас одна категория - то можно просто добавить адрес :)